Les compétences développées dans le cadre des enseignements, des stages et des missions sont définies en lien avec les référentiels de compétences managériales et transverses de la Délégation interministérielle à l'encadrement supérieur de l'Etat.
Le programme de formation initiale fait l'objet d'un référentiel de formation et d'une maquette pédagogique qui en précisent les contenus. Les détails pratiques seront précisés par décision du directeur de l'Institut.