La direction des opérations a autorité directe sur les organismes extérieurs suivants dont les missions et l'organisation sont fixées par instruction :
1. Le service des achats d'armement (S2A) ;
2. Le service du maintien en condition opérationnelle ;
3. L'unité de management Avions de chasse et équipements (UM ACE) ;
4. L'unité de management Cœlacanthe (UM COE) ;
5. L'unité de management Horus (UM HOR) ;
6. L'unité de management Nucléaire, biologique et chimique (UM NBC) ;
7. L'unité de management Socle numérique (UM SNUM) ;
8. L'unité de management Opérations d'armement terrestres (UM TER) ;
9. L'unité de management Opérations d'armement navales (UM NAV) ;
10. L'unité de management Avions de missions et de support (UM AMS) ;
11. L'unité de management Opérations d'armement hélicoptères et missiles (UM HMI) ;
12. L'unité de management Espace et systèmes d'information opérationnels (UM ESIO) ;
13. L'établissement de contrôle de Cherbourg.