La politique de prévention en santé de la CNMSS a pour objectif de mettre en œuvre un ensemble d'actions visant à améliorer l'état de santé de ses ressortissants. Cette politique couvre la prévention primaire, secondaire et tertiaire, l'éducation pour la santé et la promotion de la santé qui visent à anticiper la maladie et permettre à chacun d'agir sur sa santé.