La direction de la stratégie comprend :
- le département des études et de la prospective ;
- le département des politiques de recherche et d'innovation ;

- la mission de la coordination de la mission interministérielle recherche et enseignement supérieur et des systèmes d'information ;
- la mission de l'emploi scientifique ;
- la mission de l'information et de la culture scientifiques et techniques ;
- la sous-direction de l'appui à la tutelle et des affaires européennes.