Les marins sont rattachés, suivant les dispositions des lois et règlements en vigueur, au régime social de la caisse générale de prévoyance et de la caisse de retraite des marins français gérées par l'Établissement national des invalides de la marine (ENIM).

Tous les marins d'appui bénéficieront d'un régime de prévoyance santé (complémentaire santé) souscrite dans chaque GPM et GPFM et supporteront la part de cotisation individuelle correspondante. Le détail et les conditions de cette assurance seront repris dans les conventions particulières de chacun des ports conformément aux législations en vigueur.

La participation financière des GPM et GPFM est au moins égale à 50 % de la cotisation, le reste étant à la charge des marins d'appui.