Un comité de pilotage présidé par le directeur des services administratifs et financiers du Premier ministre définit et oriente la politique à mettre en oeuvre à cet égard.
Participent à cette instance le directeur de l'Ecole nationale d'administration, le directeur général de l'administration et de la fonction publique, le président du Comité pour l'implantation territoriale des emplois publics ou leurs représentants et le directeur de projet. Le secrétariat est assuré par la direction de projet.