Les élèves de la spécialité génie maritime du cursus de formation initiale ingénieurs sont recrutés en 3^e année par la voie d'une sélection sur titre dont les critères sont fixés par l'ENSM ou par la voie du concours pour les étudiants issus des classes préparatoires aux grandes écoles, en spécialité physique-technologie.

Les élèves et apprentis de la spécialité génie maritime du cursus de formation initiale ingénieurs sont recrutés en 4^e année par la voie d'une sélection sur titre dont les critères sont fixés par l'ENSM. L'accès à la 4^e année est également proposé aux élèves ayant validé le premier cycle du cursus de formation d'officier de 1^re classe de la marine marchande/ ingénieur.