L'équipe de direction est composée :
1° D'un directeur ;
2° D'un secrétaire général ;
3° D'un directeur scientifique.
Les membres de l'équipe de direction sont nommés par arrêté du ministre de la défense sur proposition du directeur stratégie de défense, prospective et contre-prolifération, qui recueille préalablement l'avis des membres de droit du conseil scientifique.