Les services de la Commission nationale de l'informatique et des libertés sont organisés en sept directions et un secrétariat général :

- la direction des relations avec les publics ;
- la direction de l'accompagnement juridique ;
- la direction des technologies, de l'innovation et de l'intelligence artificielle ;
- la direction de l'exercice des droits et des plaintes ;
- la direction des contrôles et des sanctions ;
- la direction des systèmes d'information ;
- la direction administrative et financière.

Les attributions des directions sont fixées par les articles suivants.