Le Conseil supérieur de la météorologie est présidé par le président-directeur général de Météo-France.
Son secrétaire permanent est nommé par le président-directeur général de Météo-France pour une durée de cinq ans.
Conformément à l'annexe 1 du décret n° 2015-622 du 5 juin 2015, le Conseil supérieur de la météorologie est renouvelé pour une durée de cinq ans à compter du 8 juin 2015 (8 juin 2020).
Conformément à l'annexe 1 du décret n° 2020-806 du 29 juin 2020, le Conseil supérieur de la météorologie est renouvelé jusqu'au 8 juin 2025.