La commission se réunit au moins trois fois par an. Elle ne peut siéger valablement que si chacun des collèges employeurs et salariés est représenté par au moins deux membres, dont le président ou le vice-président. Si cette condition n'est pas remplie, elle se réunit de nouveau sous un délai d'un mois et peut délibérer quel que soit le nombre des membres présents.
Le directeur général de la cohésion sociale convoque la commission et arrête l'ordre du jour des séances sur proposition du président.
Le programme de travail annuel est arrêté après avis de la commission, par accord entre le directeur général de la cohésion sociale et le président de la commission.A défaut d'accord, le programme est arrêté par le ministre chargé des affaires sociales.
La commission est informée régulièrement et au moins une fois par an de la suite réservée à ses travaux.