Les zones sensibles du bassin Seine-Normandie comprennent les eaux de la mer dans la limite des eaux territoriales et les bassins versants des cours d'eau suivants :

- l'Oise à l'amont d'Alaincourt ;

- la Serre à l'amont de Mesbrecourt-Richecourt ;

- l'Ailette à l'amont de Lizy ;

- l'Aisne en amont de sa confluence avec la Vesle ;

- la Marne en amont d'Epernay ;

- la Seine en amont de sa confluence avec l'Orvin ;

- l'Yonne en amont de sa confluence avec l'Oreuse ;

- le Loing en amont de sa confluence avec le Fusain ;

- l'Essonne en amont de Malesherbes ;

- l'Eure en amont de sa confluence avec la Vesgre, et l'Iton en amont de sa confluence avec le Rouloir ;

- la Risle en amont de sa confluence avec la Charentonne ;

- les fleuves côtiers autres que la Seine et la Risle entre la Sélune au Sud et la Bresle au Nord.