La commission siège en deux formations qui comprennent chacune le président ou le vice-président, les trois représentants des transporteurs aériens, le représentant de l'Aéroport de Paris ainsi que les préfets et les représentants des collectivités locales qui sont concernées soit par l'aérodrome Charles-de-Gaulle, soit par celui d'Orly.

Chacune de ces deux formations est consultée sur les affaires relatives à l'aérodrome considéré.

Le président peut éventuellement convoquer la commission en séance plénière pour des affaires intéressant les deux aérodromes.